超次元学院在上一季掌握了进入游戏世界的能力，但“次元门”在一次实验中失控，导致大量游戏角色反向穿越到现实世界。一时间，校园里充满了武侠高手、魔法师、机甲战士和像素小人，他们完全不懂现代社会的规则，把校园搅得天翻地覆。学院最废柴的学生苏不不被迫成为“跨次元管理科”负责人，她的任务是送这些角色回家，却发现其中混入了一个“不属于任何已知游戏”的未知生命体——它正在学习人类的感情，并拒绝离开。

第二季比第一季玩得更大。游戏角色穿现实的设定每一集都有新笑点，比如武侠高手被电动车吓到、魔法师用火球术点外卖。但后半段突然从沙雕转向温情，那个“不属于任何游戏”的生命体学哭的那场戏，让所有人破防。